Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms