Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg3P27681 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms