Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd40lgP27548 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms