Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
U2af2P26369 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
U2af2P26369 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms