Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnd1P25322 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms