Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1bP25119 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1bP25119 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1bP25119 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms