Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd247P24161 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms