Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja1P23242 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms