Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Eif3aP23116 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms