Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clk1P22518 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clk1P22518 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms