Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tap1P21958 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tap1P21958 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms