Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou3f1P21952 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms