Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klra1P20937 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms