Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms