Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18528 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18528 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18528 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18528 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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