Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa-rs1P17533 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa-rs1P17533 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms