Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ChgbP16014 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgbP16014 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms