Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp53P15975 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp53P15975 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms