Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnc1P15388 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnc1P15388 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms