Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrphP15331 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrphP15331 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrphP15331 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrphP15331 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrphP15331 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrphP15331 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrphP15331 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrphP15331 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrphP15331 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrphP15331 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrphP15331 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrphP15331 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrphP15331 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrphP15331 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrphP15331 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms