Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms