Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OtcP11725 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OtcP11725 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OtcP11725 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OtcP11725 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtcP11725 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms