Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga5P11688 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms