Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem254aP0DN89 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms