Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprqP0C5E4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms