Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Surf1P09925 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Surf1P09925 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms