Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtaP09225 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtaP09225 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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