Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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