Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TtrP07309 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TtrP07309 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TtrP07309 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms