Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gh1P06880 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gh1P06880 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms