Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P06323 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P06323 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P06323 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P06323 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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