Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mtnd1P03888 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtnd1P03888 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms