Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamc1P02468 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamc1P02468 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms