Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01668 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01668 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01668 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01668 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms