Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01641 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01641 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01641 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01641 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01641 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01641 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01641 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01641 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01641 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01641 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms