Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcn2O88968 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms