Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CcnkO88874 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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