Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp2O88623 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp2O88623 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms