Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnmt3bO88509 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dnmt3bO88509 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms