Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaskO70589 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CaskO70589 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CaskO70589 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CaskO70589 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms