Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vamp4O70480 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms