Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Xirp1O70373 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Xirp1O70373 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms