Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms