Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChkbO55229 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChkbO55229 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms