Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp2a2O55143 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2a2O55143 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms