Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap18O55128 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sap18O55128 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sap18O55128 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms