Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dsg2O55111 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms