Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LatO54957 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LatO54957 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LatO54957 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LatO54957 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LatO54957 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms