Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn5O54942 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn5O54942 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms