Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16O54909 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh16O54909 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms